根据中国科协发学字〔2006〕23号“关于举办2006中国科协年会的通知”要求，中国水土保持学会常务理事会研究决定，组织申办“水土保持与新农村建设高级论坛”研讨会，并按2006年学会的重点学术活动组织实施。学会于2006年3月正式向中国科协申报，并获批准， 2006年9月16－17日在北京金码大酒店召开。

参加此次“水土保持与新农村建设”学术会议正式代表69名，列席代表80名（全部为硕士和博士研究生），其中：中国工程院关君蔚院士、山仑院士和中国社会科学院荣誉院士何乃维出席会议 ；高级职称39名，中级职称19名、博士硕士9名。充分体现了本次学术会议是一次高层次、高水平的学术研讨活动。

会议共收到论文100余篇，经组织专家评审，选出63篇按中国科协征文要求将论文格式统一编辑，入选2006年科协年会光盘。

9月16日上午“农业现代化与新农村建设”第分6会场全体代表，参加2006年中国科协在人民大会堂举行的开幕式，下午中国农学会、中国农业工程学会、中国水土保持学会共同设分6会场举行开幕式及主题报告会，3个学会共特邀2位院士、多名著名专家作专题报告。中国工程院关君蔚院士和山仑院士分别作“黄土高原水土保持与新农村建设”；“关于动态跟踪监测预报的遗愿”，中国水土保持学会副理事长，北京林业大学朱金兆教授在会上作“水土保持植被建设的思考” 主题报告。院士和专家精彩的报告获得全场300多名到会人员的阵阵掌声。会议持续到18：20，听会者的专注和报告人的风采使会场学术气氛到达高潮。

9月17日全天，第6.3会场进行了学术交流。为使学术交流更具针对性，学会学术委员会特别邀请部分专家到会交流。会议由《中国水土保持科学》主编、中国水土保持学会名誉理事王礼先教授和中国水土保持学会常务副秘书长黄元副研究员主持。中国工程院山仑院士、中科院桂林岩溶研究所所长蒋忠诚研究员、中国社会科学院农村生态经济研究所、中国社会科学院首批荣誉院士何乃维研究员、水利部水土保持监测中心监测处处长李智广高工、中国社会科学院农村生态经济研究所、中宣部新农村建设宣讲团专家党国英研究员等10位专家，分别就 “黄土高原水土保持与新农村建设”；“喀斯特地区的水土保持与生态安全”；“新农村建设与水土保持”；“基于GIS的中国水蚀区侵蚀危险度抽样调查”；“新农村建设的若干问题探讨”等议题进行交流。报告人从宏观经济政策到具体技术措施，多方面、多角度的讲述水土保持在新农村建设中的成效、应注意或应避免的问题。